精确DNA甲基化测序技术

精确DNA甲基化测序技术可应用于高通量测序平台（如全基因组甲基化测序oxWGBS、简化的甲基化测序oxRRBS等常规测序技术）；Infinium 450 K芯片检测平台；焦磷酸测序和靶基因检测等不同平台。对于全面研究胚胎发育、衰老机制、疾病发生发展的表观遗传机制和筛选疾病相关的甲基化标记位点具有重要的意义。

精确DNA甲基化测序技术

数据解读分析内容

1. 基本数据处理
   • 原始数据评估，去除接头与过滤低质量数据；
   • reads数量以及数据产出统计。
2. 基础生物学信息分析
   • 将测序数据与参考基因组比对，统计比对结果；
   • 基于比对结果，统计各C位点的甲基化修饰信息；
   • 测序数据的碱基覆盖深度及覆盖度统计；
   • 胞嘧啶（CG、CHG、CHH）甲基化水平统计；
   • 基因组甲基化分布及修饰特征分析；
3. 高级生物学信息分析
   • 结合项目背景的差异甲基化修饰位点(DMS)的鉴定、注释和分布分析；
   • 结合项目背景的差异甲基化修饰区域(DMR)的鉴定、注释和分布分析；
   • 结合项目背景的差异甲基化修饰基因的功能、通路和疾病等富集分析；
   • 结合项目背景，与其他多组学数据的关联分析。

样本要求

1. 样品类型：无降解，无污染的DNA样品；
2. 样品需求量：≥3μg；单个样品构建2个不同的文库；
3.  样品浓度：≥30 ng/μl;
4. 样品纯度：OD260/280=1.8~2.0