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全基因组甲基化测序技术(WGBS)

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更新时间:2018-10-09 10:20:34浏览次数:1498

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产品简介

全基因组甲基化测序技术(WGBS)可以在全基因组范围内检测所有单个胞嘧啶碱基(C碱基)的甲基化水平。能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术服务,能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中,也是各物种甲基化图谱研究的优选方法。

详细介绍

全基因组甲基化测序技术(WGBS)可以在全基因组范围内检测所有单个胞嘧啶碱基(C碱基)的甲基化水平。能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术服务,能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中,也是各物种甲基化图谱研究的优选方法。可应用于稀有样本,如胚胎细胞、肿瘤干细胞等的全基因组甲基化研究。

全基因组甲基化测序技术(WGBS)常规起始量WGBS:运用约1微克的基因组DNA进行文库构建和重亚硫酸盐处理。可根据物种基因组大小和测序数据量增加构建文库的个数,减少测序bias,确保甲基化检测的准确性。

 

数据解读分析内容

1.数据产出、过滤和质控

     。下机数据过滤和质控图表

2.数据比对、甲基化信息

    。比对结果、Bisulfite转化率统计

     。覆盖度以及覆盖深度统计

     。甲基化修饰位点及水平结果

3.甲基化修饰特征                      .

      。甲基化修饰位点和水平的特征及统计

4.差异甲基化修饰区域

      。差异甲基化修饰区域(DMR)的鉴定和注释

5.差异甲基化修饰基因

       。差异甲基化修饰基因功能和通路分析

样本要求

  1. 样品类型:无降解,无污染的DNA样品;
  2. 样品需求量:≥2μg;
  3.  样品浓度:≥30 ng/μl;
  4. 样品纯度:OD260/280=1.8~2.0

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