主板是电脑的核心部件,无论是商用的还是工业级的,电脑就是通过主板将CPU等各种器件和外部设备有机地结合起来，形成一套完整的系统，因此电脑的整体运行速度和稳定性在相当程度上取决于主板的性能。
PC104 工业主板由于其应用范围更广泛，使用环境更复杂，因此用户对其功能、兼容性、可靠性要求更高。
根据主板的结构和尺寸可以分成：全长卡，半长卡，5.25寸，3.5寸，PC104架构等。按选用芯片系列分：386，486，586，PIII，P4，ATOM,等。按芯片类型分：X86架构，MIPS架构，ARM架构等。还有一些根据客户需求定制的部分。
PC104 工业主板元器件一般不同于商业用料，需要考虑耐高温、抗潮湿等工业场合需求。
平台选项：
PC104 工业主板一般采用低功耗芯片组，以便节约能耗，同时提高环境适应能力。常见的平台从IntelCore，Nehalem到2012年主推的Sandybridge/Ivybridge，及ATOM凌动平台，AMD的LX系列（LX800)到Fusion等。
接口设计：PC104 工业主板由于使用场合特殊，因此设计接口会根据使用场合做定制或堆砌大量标准接口以适应各种接口。常见接口有串口，USB，LAN，LPT等，为了适应环境，一般都带有防浪涌冲击，放静电等设计。扩展接口有PC104家族，PCI-E家族，PCI家族等，配合工业母板，底板使用支持多个扩展。同时带多种显示功能如VGA，LVDS，HDMI，DVI接口等。
生命周期：工业使用以稳定为前提，因此希望有长时间的稳定供货周期，以保证整体设备或系统的稳定。
保护功能：
PC104 工业主板通过特殊设计，在遇到死机等异常情况，可以实现看门狗自动重新启动全力的保证系统在恶劣环境的高稳定性的要求。
在选购PC104 工业主板时，首先要观察PC104 工业主板的制造工艺。检测PC104 工业主板的制造工艺一看主板做工是否精细，如电路板(PCB)的层数是否为多层板(好是6层以上)、各焊点接合处及波峰焊点是否工整简洁、走线是否简洁清晰；二看主板元件；三看设计结构是否符合未来升级安装的需要、结构布局是否合理，是否利于安装其他配件和散热处理器件；四看主板是否通过相应的安全标准测试；后看主板产品包装和相关配件，其各种连接线、驱动盘、保修卡等是否齐全。
PC104 工业主板质量检测方法有：主板电池，观察电池是否生锈、漏液；芯片的生产日期，主板的速度不仅取决CPU的速度，同时也取决于主板芯片组的性能。扩展槽插卡，一般ISA扩展槽比PCI扩展槽更易观察，其方法是先仔细观察槽孔的弹簧片的位置形状，再把ISA卡插入槽中后拔出，观察现在槽孔内的弹簧片位置形状是否与原来相同；软件测速，可以通过它来了解PC104 工业主板的性能，较好的测速软件有SPEED系列和SST系列的测速软件。
选购
PC104 工业主板时需要考虑工控机和主板将来升级扩展的能力，如扩充内存和增加扩展卡、升级CPU等方面的能力。主板插槽越多，扩展能力就越好，相对价格也更贵。
